A Pró-Reitoria de Pesquisa, Pós-graduação e Extensão é o órgão responsável por assessorar a administração da universidade nos assuntos relativos à pesquisa e pós-graduação, bem como pela consolidação das atividades na Universidade de Uberaba, respeitando o princípio da indissociabilidade entre ensino, pesquisa e extensão.

Dessa forma, por meio de sua Coordenação de Pesquisa, apoia os Institutos e grupos de docentes na consolidação de seus laboratórios e de seus núcleos de pesquisa, coordena o Programa Institucional de Apoio a Pesquisa-PAPE, que oferece financiamento para o desenvolvimento de projetos institucionais de pesquisa; o Programa de Iniciação Científica que estimula as atividades de pesquisa de seus alunos, orientados por docentes da instituição; apoia a participação dos docentes e alunos vinculados a núcleos de pesquisa em eventos científicos.

Apoia os Institutos e grupos de docentes na elaboração de propostas de cursos de pós-graduação "lato e stricto sensu"; apoia os Institutos e grupos de docentes na implantação de programas de pós-graduação "stricto sensu" e gerencia o Programa de Capacitação Docente da Universidade de Uberaba.